ความสัมพันธ์อันแน่นแฟ้นระหว่างประเทศไทยและญี่ปุ่น มิได้มีเพียงด้านเศรษฐกิจอุตสาหกรรมเท่านั้น แต่ยังมีความสัมพันธ์อันใกล้ชิดด้านวิชาการเทคโนโลยีมายาวนานอีกด้วย ซึ่งเป็นหัวใจสำคัญของการพัฒนาบุคลากร การศึกษาของประเทศ และการพัฒนาอย่างยั่งยืน เมื่อเร็วๆนี้ สองมหาวิทยาลัยชั้นนำของเอเชียที่มีชื่อเสียงระดับโลก มหาวิทยาลัยเกียวโต ร่วมกับมหาวิทยาลัยมหิดล จัดงานประชุมเชิงปฏิบัติการด้านสิ่งแวดล้อมครั้งที่ 5 (The 5th Kyoto University - Mahidol University on-Site Laboratory Workshop) โดยมี ศาสตราจารย์ นายแพทย์บรรจง มไหสวริยะ อธิการบดีมหาวิทยาลัยมหิดล และ ศาสตราจารย์ ยาสุยูกิ โคโนะ (Prof. Yasuyuki Kono) รองอธิการบดี มหาวิทยาลัยเกียวโต ประเทศญี่ปุ่น เป็นประธานในพิธีเปิด พร้อมด้วย รศ.ดร. ธนภัทร์ วานิชานนท์ ผู้บริหารและอาจารย์ นักวิจัยจากทั้ง 2 มหาวิทยาลัย ร่วมระดมข้อคิดเห็นและแลกเปลี่ยนองค์ความรู้ในงานวิจัยพัฒนาไทย - ญี่ปุ่น รศ.ดร.จักรกฤษณ์ ศุทธากรณ์ คณบดีคณะวิศวกรรมศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล กล่าวว่า ปัญหาด้านสิ่งแวดล้อมในปัจจุบันได้กลายเป็นปัญหาใหญ่ของโลกนั้น การบรรเทาความรุนแรงและแก้ปัญหาสิ่งแวดล้อมต้องใช้พหุศาสตร์ การมีส่วนร่วม และเครือข่ายความร่วมมือจากทุกภาคส่วนจึงจะบรรลุผลได้ ดังนั้นคณะวิศวกรรมศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล สาขาวิชาวิศวกรรมสิ่งแวดล้อมและทรัพยากรทางน้ำ (หลักสูตรนานาชาติ) ภาควิชาวิศวกรรมโยธาและสิ่งแวดล้อม ได้พัฒนาความร่วมมือกับ Graduate School of Global Environmental Studies มหาวิทยาลัยเกียวโต มาอย่างต่อเนื่อง และได้รับอนุมัติให้มีการจัดตั้ง ห้องปฏิบัติการวิจัยของ ม.เกียวโต ณ คณะวิศวกรรมศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล (Kyoto University On-Site Laboratory at Mahidol University for Educational and Research Collaboration in Environmental Studies) เพื่อใช้เป็นฐานปฏิบัติการวิจัยพัฒนาด้านสิ่งแวดล้อมร่วมกัน โดยทั้งสองมหาวิทยาลัยมีการจัดงานประชุมวิจัยเชิงปฏิบัติการ (On-Site Laboratory Workshop) เป็นประจำทุกปีมาอย่างต่อเนื่อง